В противовес этому в фазы засушливого климата обе реки становились маловодными,
уровень Арала тоже падал и росла степень засоления Приаралья. В историческое время с момента
существования древнего Хорезма изменения уровня зависели, в некоторой степени, от изменения климата,
но в основном от ирригационной деятельности в регионе по обеим рекам. В периоды интенсивного
развития прилежащих к Аралу стран увеличение орошения земель приводило к изъятию большей части воды
для этой цели, и уровень воды в Арале незамедлительно снижался. В течение неблагоприятных периодов в
регионе (войны, революции и т. д.) орошаемые земли сокращались, и реки, и Арал опять наполнялись
водой.
Результаты этих работ были обобщены в 1908 г.
Л. Бергом в его известном труде «Очерк истории исследований Аральского моря», где он констатирует,
что ни у одного из греческих и римских авторов не было прямого или косвенного упоминания об
Аральском море, но многие из них говорят об Оксе (Амударье) и Аксарте (Сырдарье), не ясно куда
впадавших. По свидетельствам известного хорезмского ученого Аль Беруни, умершего в 1048 г.,
хорезмийцы ведущие свое летоисчисление от 1292 г. до Рождества Христова свидетельствуют о
существовании Аральского моря.
Геологические и гидрологические изыскания, проведенные А.С. Кесь и целым рядом
выдающихся географов в 80-х годах прошлого столетия показали, что Амударья и Сырдарья, постоянно
меняя свои трассы и мигрируя по системе Средней Азии в исторический период часто не достигали
Аральского моря, Аральское море высыхало, а на его территории образовывалось пустынная местность.